Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Abcf3Q8K268 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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