Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms