Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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