Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms