Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp27Q8CEG8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Usp27Q8CEG8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Usp27Q8CEG8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Usp27Q8CEG8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Usp27Q8CEG8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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Usp27Q8CEG8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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