Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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