Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tsr2Q8C8T8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tsr2Q8C8T8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tsr2Q8C8T8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tsr2Q8C8T8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tsr2Q8C8T8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tsr2Q8C8T8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tsr2Q8C8T8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tsr2Q8C8T8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tsr2Q8C8T8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tsr2Q8C8T8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tsr2Q8C8T8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tsr2Q8C8T8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tsr2Q8C8T8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tsr2Q8C8T8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tsr2Q8C8T8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tsr2Q8C8T8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tsr2Q8C8T8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tsr2Q8C8T8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tsr2Q8C8T8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tsr2Q8C8T8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tsr2Q8C8T8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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