Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp44Q8C2S0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms