Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hdac7Q8C2B3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hdac7Q8C2B3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hdac7Q8C2B3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hdac7Q8C2B3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hdac7Q8C2B3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hdac7Q8C2B3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hdac7Q8C2B3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Hdac7Q8C2B3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Hdac7Q8C2B3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Hdac7Q8C2B3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Hdac7Q8C2B3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hdac7Q8C2B3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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