Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms