Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdcl3Q8BVF2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Pdcl3Q8BVF2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Pdcl3Q8BVF2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Pdcl3Q8BVF2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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