Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms