Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp54Q8BL06 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp54Q8BL06 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms