Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ubash3bQ8BGG7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ubash3bQ8BGG7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ubash3bQ8BGG7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubash3bQ8BGG7 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ubash3bQ8BGG7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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