Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnpo1Q8BFY9 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123 ms