Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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H2-M10.4Q85ZW8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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H2-M10.4Q85ZW8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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H2-M10.4Q85ZW8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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