Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Smim19Q80ZU4 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Smim19Q80ZU4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Smim19Q80ZU4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Smim19Q80ZU4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Smim19Q80ZU4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Smim19Q80ZU4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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