Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp8Q80U87 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp8Q80U87 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp8Q80U87 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp8Q80U87 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp8Q80U87 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp8Q80U87 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp8Q80U87 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp8Q80U87 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp8Q80U87 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms