Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
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