Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
IfnkQ7TSL0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
IfnkQ7TSL0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms