Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Dsg1bQ7TSF1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Dsg1bQ7TSF1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Dsg1bQ7TSF1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Dsg1bQ7TSF1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Dsg1bQ7TSF1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1bQ7TSF1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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