Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Cnih3Q6ZWS4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Cnih3Q6ZWS4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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