Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Ccdc88cQ6VGS5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
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Ccdc88cQ6VGS5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Ccdc88cQ6VGS5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Ccdc88cQ6VGS5 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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