Protein–RNA interactions for Protein: Q6RT24

Cenpe, Centromere-associated protein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpeQ6RT24 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CenpeQ6RT24 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms