Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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Zbtb40Q6PCS8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Zbtb40Q6PCS8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbtb40Q6PCS8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms