Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ttbk1Q6PCN3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms