Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Krt40Q6IFX3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Krt40Q6IFX3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Krt40Q6IFX3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Krt40Q6IFX3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Krt40Q6IFX3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt40Q6IFX3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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