Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Atg9bQ6EBV9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Atg9bQ6EBV9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Atg9bQ6EBV9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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