Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Pkp4Q68FH0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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Pkp4Q68FH0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Pkp4Q68FH0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
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