Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PtprdQ64487 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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PtprdQ64487 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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PtprdQ64487 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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PtprdQ64487 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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PtprdQ64487 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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PtprdQ64487 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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PtprdQ64487 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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PtprdQ64487 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprdQ64487 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprdQ64487 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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