Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Ccdc18Q640L5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Ccdc18Q640L5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Ccdc18Q640L5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc18Q640L5 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms