Protein–RNA interactions for Protein: Q62351

Tfrc, Transferrin receptor protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfrcQ62351 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TfrcQ62351 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms