Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lrrn1Q61809 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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Lrrn1Q61809 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Lrrn1Q61809 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrn1Q61809 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms