Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms