Protein–RNA interactions for Protein: Q61477

Nbl1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbl1Q61477 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Nbl1Q61477 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nbl1Q61477 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms