Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Pde3bQ61409 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pde3bQ61409 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pde3bQ61409 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pde3bQ61409 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pde3bQ61409 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pde3bQ61409 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pde3bQ61409 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pde3bQ61409 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pde3bQ61409 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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