Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
PcolceQ61398 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms