Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Foxd1Q61345 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Foxd1Q61345 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Foxd1Q61345 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Foxd1Q61345 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Foxd1Q61345 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Foxd1Q61345 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Foxd1Q61345 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Foxd1Q61345 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Foxd1Q61345 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Foxd1Q61345 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Foxd1Q61345 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Foxd1Q61345 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Foxd1Q61345 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Foxd1Q61345 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Foxd1Q61345 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Foxd1Q61345 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Foxd1Q61345 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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