Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mre11Q61216 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mre11Q61216 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mre11Q61216 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mre11Q61216 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms