Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RelnQ60841 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RelnQ60841 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RelnQ60841 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms