Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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