Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms