Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprnQ60673 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms