Protein–RNA interactions for Protein: Q60665

Skil, Ski-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkilQ60665 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkilQ60665 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkilQ60665 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkilQ60665 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkilQ60665 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkilQ60665 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkilQ60665 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkilQ60665 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SkilQ60665 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms