Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Psme4Q5SSW2 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms