Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms