Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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