Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam220aQ3ZN08 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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