Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms