Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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